BAİBÜ Kimya Mühendisliği Yüksek Lisans programı kimya mühendisliği spesifik ve diğer ilgili alan konularını kapsayan teorik ve uygulamalı, zorunlu ve seçmeli dersleri içerir. Seçmeli dersler, Kimya Mühendisliği ve BAİBÜ’ nün başka bölümlerinde sunulmakta olan diğer derslerden de oluşabilir. Programda sunulan dersler aşağıdaki linkteki gibidir: